Hvad er et transkriptom?

Transkriptomet er en komplet samling af RNA fra en organisme, en gruppe celler eller endda en specifik celle.RNA syntetiseres fra DNA gennem en proces kendt som transkription.RNA, der er til stede i en celle, og kroppen bestemmer, hvilke gener der vil blive udtrykt, og det ændrer sig i løbet af et organismers liv, i modsætning til DNA, som forbliver statisk.Miljøtryk er en af de førende grunde til ændringer, da kroppen forsøger at tilpasse sig skiftende miljøsituationer for at holde sig selv fungerer.

Transkriptomet er meget mindre end et organismer genom, den komplette samling af DNA i organismen.Sæt på enkle termer, man kunne tænke på DNA som en kogebog, der viser en komplet samling af opskrifter, der kan laves.Transkriptomet er den kode, der bestemmer, hvilke opskrifter der skal foretages, og hvornår.Kogebogen forbliver statisk gennem hele livet, mens transkriptomet ændres som respons på miljøfaktorer.

En vigtig del af transkriptomet er mRNA -molekyler.Messenger RNA er RNA, der kommunikerer med ribosomerne i cellerne for at dirigere cellerne til at fremstille forskellige proteiner.Disse proteiner bruges til en lang række funktioner.Andre dele kan muligvis ikke direkte kode for proteinproduktion, men gør ting som at bestemme cellestruktur og regulere genekspression.Sammen holder de forskellige komponenter i transkriptomet en organisme, der fungerer og bestemmer genekspression i denne organisme.

Inden for forskellige celler i kroppen kan transkriptomet være meget anderledes.Leverceller har for eksempel RNA, der gør dem til leverceller, og sikrer, at cellerne udfører nødvendige funktioner.På den anden side har hudceller et andet transkriptom, der aktiverer de gener, der er nødvendige for at gøre en celle til en hudcelle.Både lever- og hudceller har en komplet kopi af genomet, men deres transkriptomer bestemmer, hvilke dele af genomet der er aktiveret.

Ligesom med DNA er det muligt at sekvensere RNA.Transkriptomsekventering kan udføres for at lære mere om handlingerne fra en celle og værtsorganismerne DNA og for at identificere de steder, hvor udtrykket af genetisk information går galt.Når en levercelle for eksempel bliver ondartet, skyldes det, at transkriptomet ikke fungerer som det skal være, og gener for malignitet er blevet aktiveret, eller cellerne mangler regulering på en eller anden måde, hvilket får dem til at vokse ud af kontrol.Sekventering af RNA i en ondartet celle kan hjælpe en forsker med at finde ud af, hvilket gen der blev aktiveret eller inaktiveret for at forårsage malignitet.