Hvad er en peptidsekvens?

Peptider er biologiske polymerer dannet ved sammenkobling af aminosyrer, hvis nøgleelementer er kulstof (C), brint (H), ilt (O) og nitrogen (N).Udtrykket peptidsekvens henviser til den rækkefølge, hvor aminosyrer er forbundet.Peptider er meget vigtige i levende systemer og kombineres for at danne meget større kæder kaldet proteiner.Selvom der er mange sorter af biologiske peptider, er de fleste af disse sammensat af kun 20 aminosyrer.Proteiner udfører en række biologiske funktioner, herunder som enzymer og i strukturen af cellevægge i planter og membraner i dyreceller.

Aminosyrer kaldes så, fordi de har amin (-NH ₂ ) og carboxylsyre (-co ₂ h) grupper.De fleste af aminosyrerne, der findes i biologiske systemer, har den generelle formel R-CH (NH ₂ ) -co ₂ H, hvor R er en række grupper.Den varierende struktur af R er det, der påvirker strukturen og egenskaberne af peptider og proteiner.

Peptidsyntese forekommer, når en aminosyresaminegruppe reagerer med carboxylsyregruppen på en anden aminosyre.Resultatet er dannelsen af en amidgruppe af struktur -N (H) -co- hvor nitrogen-til-carbon-bindingen kaldes en peptidbinding.Reaktionen kan finde sted et vilkårligt antal gange for at danne en peptidsekvens af forskellige funktionelle grupper, som hver er ispedd af en amidgruppe.

peptider og proteiner har forskellige niveauer af struktur.Primær proteinstruktur er den rækkefølge, hvor aminosyrerne findes;Dette er dens peptidsekvens.De funktionelle grupper på proteinet interagerer med hinanden for at trække det i en form.De individuelle vendinger og sving af et peptid kaldes dets sekundære struktur.Dens overordnede form, nettoresultatet af alle disse vendinger, er den tertiære struktur.

De biokemiske egenskaber ved proteiner eller peptider afhænger af tertiær struktur.Som med alle kemikalier vil proteiner antage den mest energisk gunstige form.Denne form er på grund af attraktive og frastødende kræfter mellem grupperne på de individuelle aminosyrer.Derfor er tertiær struktur på grund af den primære struktur, hvilket betyder, at det at udlede peptidsekvensen af et bestemt protein i sidste ende vil forklare dets egenskaber.

Udarbejdning af peptidsekvensen af et protein har anvendelser til design af farmaceutiske stoffer.Mange biologiske processer afhænger af proteinernes handlinger, og lægemidler fungerer ofte ved enten at kopiere eller blokere virkningen af disse proteiner.At forstå proteinernes opførsel kan føre til design af mere effektive lægemidler.Af denne grund har forsknings- og udviklingsafdelingen for et farmaceutisk selskab typisk et peptidbibliotek eller peptidkatalog, som det vil bruge i søgningen efter nye lægemidler.